O laboratório dá apoio à clínica e cirurgia das diferentes espécies. Permite realizar:
- Hemograma
- Análises bioquímicas
- Ionograma e gases arteriais
- Lactémia e glicémia
Os dois microscópios do hospital permitem a avaliação de esfregaços de sangue, raspagens de pele e citologias.
Alguns dos aparelhos são também portáteis e permitem o acompanhamento de provas de endurance equestre e avaliação da condição física dos cavalos durante o treino.